城市建設學院設有建築工程技術研究所、建築環境研究所、環境與市政工程研究所、村鎮發展與規劃研究所等四個科研機構。

建築環境研究所：

該所成立于2004年，主要成員21人。主要研究農村及城鎮生态環境規劃理論與方法以及建築環境藝術與節能設計理論與方法。近年來承擔教育部科學研究項目1項，湖北省自然科學基金項目1項，省教育廳研究項目13項，孝感學院科研項目27項。公開發表科研論文200篇，其中EI收錄4篇。

建築工程技術研究所：

骨幹研究人員11人，主要從事土木建築工程的設計 施工和管理方面的新技術研究和推廣應用工作。研究的主要方向包括：建築結構仿真技術；建築施工新技術；城市給排水和防洪工程技術；結構檢測與加固技術等。完成科研項目：省級3項，校級5項，承擔橫向課題4項，發表相關研究論文30餘篇。研究開發的鋼筋水泥套梁專項技術得到推廣應用。主持完成危舊房改造加固20餘項。

環境與市政工程研究所：

該所成立于2010年，骨幹研究人員10人，研究方向：城市水污染控制與資源化技術；城市飲用水安全保障技術；城市大氣污染控制與資源化技術；城市固體廢棄物污染控制與資源化技術；環境生物技術；城鎮市政工程咨詢。

村鎮發展與規劃研究所：

該所成立于2010年，研究成員12人，以“立足湖北，開創中部，服務全國”的研究宗旨。主要研究内容為：鎮、鄉、村莊選址研究，鎮、鄉、村莊空間發展研究，鎮、鄉、村規劃研究和咨詢，縣、鎮、鄉土地利用研究，小建築設計、建築環境等研究，鎮村統籌發展研究，縣鎮控制性規劃研究，縣、鄉鎮城鎮體系規劃研究，縣、鄉鎮總體規劃研究，縣、鎮、鄉近期建設研究，縣、鎮、鄉經濟社會發展研究等。